Uma abordagem de docking e dinâmica molecular por etapas para a produção enzimática de biodiesel utilizando combolipases de Candida antarctica como biocatalisadores
Lipases; CALA-CALB; Docking Molecular; Biodiesel; Biocatalise.
O biodiesel destaca-se por suas vantagens ambientais, como emissões reduzidas de monóxido de carbono e material particulado em comparação com o diesel. Para aprimorar a eficiência na produção de biodiesel, é essencial realizar um estudo teórico por meio de modelagem molecular, visando a redução de custos associados a experimentos e reagentes. Nesse contexto, uma simulação de docking molecular foi conduzida, baseando-se em reações de esterificação, estimativa do grau de síntese e estudo in silico com preparação de ligantes e proteínas. Os resultados revelaram a presença da conformação de ataque próximo (NAC) em reações de hidrólise por biocatálise mista entre o substrato e duas lipases: CALA e CALB. Com uma energia livre de -8,5 kcal/mol e um RMSD de 1,54 Å, a pose de melhor estabilidade demonstrou fortes interações com o ácido oleico, indicando a participação de resíduos específicos (Ser 184, His 366 e Asp 334) para a lipase CALA e (Asp 187, His 224 e Ser 105) para a CALB. As simulações de dinâmica molecular corroboraram uma notável estabilidade, sugerindo que as conformações de acoplamento selecionadas permitiram a ocorrência da reação sem obstáculos. Em ambos os cenários, os resultados foram moderados e ligeiramente aproximados, indicando que as enzimas comerciais, CALA e CALB apresentam bom desempenho com etanol, sendo a interação mais destacada com o ácido oleico observada na CALA. A análise do gráfico de Ramachandran revelou que 92,7% dos resíduos estavam em regiões favoráveis, 1,5% em regiões generosamente permitidas e 0,4% em regiões desfavoráveis. Este estudo bem-sucedido modelou as interações entre as combolipases de Candida antarctica como biocatalisadores e potenciais substratos para uso na produção de biodiesel. No entanto, ressalta-se que o tipo de ácido carboxílico utilizado exerce significativa influência no desempenho das enzimas, evidenciando-se através da aproximação entre a carbonila do ácido e os resíduos favoráveis das lipases, bem como interações hidrofóbicas do tipo alkyl com outros resíduos, foram observados.